增值税
工程款收入首先需要关注的就是增值税。根据《增值税法》，建筑业作为特殊行业，通常需要缴纳增值税。增值税的计算通常依据开票金额进行，税率为9%。例如，若企业收到工程款100万元，则需要缴纳增值税9万元。

具体缴纳方式:

• 企业在提供建筑服务后，依据合同约定收取工程款。
• 通过发票确认增值税金额，并按时缴纳税款。

特别注意:

• 对于符合条件的小规模纳税人，其增值税税率可能会降低至3%。
• 如果使用简易计税方法，也可能适用于较低的税率。

企业所得税
在中国，企业所得税是对企业盈利的课税。企业从工程项目中获得的收入，若产生了盈利，就需要按照企业所得税法缴纳企业所得税。当前的企业所得税税率为25%。但有些地区或企业类别可享受优惠税率，具体税率可根据地方政策进行调整。

计算方式:

• 企业的总收入减去可以抵扣的成本和费用后，剩余部分即为应纳税所得额。
• 根据应纳税所得额按比例缴纳企业所得税。

印花税
印花税是指对经济活动中使用的各类合同、协议以及产权转移等文件进行征税。在工程款收入方面，当签订合同或者付款时，相关合同往往需要缴纳印花税。印花税通常按合同金额的一定比例征收。

征收标准:

• 建筑工程合同一般为合同金额的0.05%
• 付款或收款合同，税率通常为0.03%

需要注意的是，印花税的缴纳需要通过盖章的方式来完成，企业在签署合同后应及时进行申报和缴纳。

个人所得税
虽然工程款主要是企业收入，但如果该项目涉及到个人劳务费用或者利润分配，还可能涉及到个人所得税。如果企业将收入分配给个人股东或员工，这部分收入可能需要缴纳个人所得税。个人所得税的税率依收入的性质和金额而异。

税率:

• 对于工资薪金所得，适用按级数递增的税率，最高可达到45%
• 对于股息分红，税率通常为20%

个人所得税的计算需要根据个人的收入情况进行，涉及到的纳税人必须向税务机关报告其收入来源。

城市维护建设税和教育费附加
除了上述税种外，工程款收入还可能涉及城市维护建设税和教育费附加等附加税。这些附加税通常是根据增值税、消费税等主要税种的缴纳金额进行附加。具体税率和缴纳标准依据企业的纳税地点和规模有所不同。

税率参考:

• 城市维护建设税的税率通常为7%、5%或1%，具体适用标准依据企业所在城市的类别而定。
• 教育费附加税率一般为3%。

其他特殊税种
在特定情况下，工程款收入还可能涉及一些特殊税种。例如，若某些项目属于环保项目或具有其他特殊性质，还可能受到环境保护税或土地增值税等的影响。